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超實用丨一文學(xué)會使用免費軟件構(gòu)建納米結(jié)構(gòu)(附下載)
來源:科學(xué)10分鐘 時間:2022-05-15 21:40:04 瀏覽:7154次


構(gòu)建納米結(jié)構(gòu)的免費軟件——Nanotube Modeler簡介

納米管、納米錐、石墨烯和富勒烯作為納米結(jié)構(gòu)的基本單元,是豐富多彩的納米世界的物質(zhì)基礎(chǔ)。為了研究這些結(jié)構(gòu)的豐富性質(zhì),首先需要對這些結(jié)構(gòu)進行建模,通常來說免費和收費的商業(yè)軟件能構(gòu)建一部分納米結(jié)構(gòu),但具有局限性。本文主要介紹內(nèi)容如下:


01

軟件的下載與安裝


Nanotube Modeler最新版本為1.8,現(xiàn)階段支持Windows版本,可由http://www.jcrystal.com/products/wincnt/NanotubeModeler.exe免費下載。

下載完成后,可以自行選擇位置進行安裝。


02

軟件的基本使用與建模




打開軟件,默認會進入納米管結(jié)構(gòu)的構(gòu)建。

 

單擊鼠標(biāo)左鍵并移動可以旋轉(zhuǎn)結(jié)構(gòu),單擊鼠標(biāo)右鍵前后拉動可以改變模型大小,雙擊鼠標(biāo)可以恢復(fù)初始視角。通過View菜單中最后三項,可以調(diào)節(jié)顯示方式為鍵線式,球棍式和比例填充模型。Toggle Projection可以調(diào)節(jié)正交和投影顯示方式。

 


2.1 碳納米管的構(gòu)建

通過在菜單中選擇Nano-Tube會生成默認的碳納米管,選擇C-C則表示當(dāng)前構(gòu)建的為碳納米管,也可更改此選項構(gòu)建B-N納米管等。

調(diào)節(jié)Chirality(n,m)可以控制納米管的手性,構(gòu)建zigzag和armchair型納米管。MWNT設(shè)置可以構(gòu)建多層納米管,其中第一個參數(shù)為多層納米管的層數(shù),后兩個參數(shù)為多壁納米管的手性。

對于彎曲的納米管,可以通過Tube Distortions選項進行調(diào)節(jié),控制納米管的彎曲程度。

如圖參數(shù)可構(gòu)建雙層納米管

 

2.2 納米錐的構(gòu)建

納米錐從結(jié)構(gòu)上類似于封端納米管,可由Special-Capped Tube選擇構(gòu)建??梢赃x擇單側(cè)封端和兩側(cè)封端。構(gòu)建參數(shù)的調(diào)節(jié)類似于碳納米管。

 

下圖為施加霧化效果的單端封端納米錐

 

2.3 富勒烯結(jié)構(gòu)的構(gòu)建

富勒烯又稱巴基球,為一維納米結(jié)構(gòu)。Nanotube Modeler內(nèi)置一個富勒烯結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫,可以通過File-Import Structure-Import Fullerene打開。

其中每個文件夾下都有固定組成具有不同對稱性的結(jié)構(gòu)。采用彩虹色著色的巴基球顯示效果如下:

 

2.4 層狀納米結(jié)構(gòu)的構(gòu)建

通常來說,層狀納米結(jié)構(gòu)的代表性結(jié)構(gòu)為蒄狀物和石墨烯。由一個苯環(huán)作為起始結(jié)構(gòu),六個邊連接苯環(huán),形成蒄,即六苯并苯。在蒄的基礎(chǔ)上繼續(xù)生長生成蒄狀物。理論上無限生長的蒄裝物與石墨烯等價。

 

兩者的構(gòu)建均可以從Select Type中選取調(diào)節(jié)。對于多層石墨烯,需要從Tools-Multi-Layer Graphene中構(gòu)建。

 


2.5 其他結(jié)構(gòu)構(gòu)建

除了構(gòu)建以上結(jié)構(gòu),Nanotube Modeler還可以構(gòu)建諸如異質(zhì)結(jié)(需要Java環(huán)境),病毒,納米泵等結(jié)構(gòu),其效果如圖所示。

 

03

一些使用建議


對于作圖為目的的使用,應(yīng)該嘗試導(dǎo)出相應(yīng)的結(jié)構(gòu)文件,使用3DMax, C4D等軟件可以得到更加精美的圖片,也可以從Tools-Lanuch POV-Ray導(dǎo)出.pov文件進行渲染。


04

總結(jié)


本文通過介紹免費的建模軟件Nanotube Modeler,實現(xiàn)了對于納米管,納米錐,富勒烯和層狀納米結(jié)構(gòu)的構(gòu)建,希望能夠幫助讀者方便構(gòu)建納米結(jié)構(gòu),從而為進一步計算和作圖打下基礎(chǔ)。


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全部 3小時前 四川
文字是人類用符號記錄表達信息以傳之久遠的方式和工具?,F(xiàn)代文字大多是記錄語言的工具。人類往往先有口頭的語言后產(chǎn)生書面文字,很多小語種,有語言但沒有文字。文字的不同體現(xiàn)了國家和民族的書面表達的方式和思維不同。文字使人類進入有歷史記錄的文明社會。
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